有主要研究目的在於評估我國即將實施的水污染排放費課徵制度，並且由制度比較的觀點來解析該制度與傳統命令及控制措施在效率與執行效果方面的差異與優劣。本文利用文獻調查的方式，對水污染排放費(稅)課徵制度的理論與實務進行描述之外，同時也將利用經濟模型建構與推導演繹的方式進行分析。本文結論發現，就命令與控制制度與水污費課制度之比較而言，雖然水污費課徵制度效率較高，但依照一般均衡分析觀點解析，稅費的課徵有造成整體經濟萎縮與人民福祉大降低的可能，因此在稅收循環問題上，水污費如果能達成雙重紅利效果將會是較好的政策。此外，根據本研究經濟模型分析證明，不論是在命令與控制或水污費課徵制度下，廠商匿報狀況主要與政府稽查執行成效及廠商所負擔的成本高低有關，由此可知污染管制政策的徹底執行才是解決污染防治成效不彰的主要良方。