運用微膠囊化技術具有降低蕊物質和外界環境的反應性、減緩或控制蕊物質釋放等優點。本研究以微膠囊化技術應用於生物發酵,以共凝聚方式將紅麴菌包覆製成微晶球,探討其生產抗氧化保健物質的效果。實驗發現紫紅麴菌(Monascus purpureus CCRC 31615)於米飯上的發酵產物具抗氧化活性,其清除自由基的效果隨發酵萃取液濃度增加而增加。在培養五天內,抗氧化效果隨培養天數增加而增加。由製備所得生物膠囊化紅麴之粒徑為819±126μm、包覆菌量為8 log孢子數/克、水份含量為90.89%。生物膠囊化紅麴能有效維持紫紅麴菌於貯存中安定,並能以液相培養基重新增殖。生物膠囊化紅麴可在發酵時限制孢子的釋出,而能釋放抗氧化物質至膠囊外,此結果顯示生物膠囊化紅麴具有菌種保存與類似生物反應器功能。