自媒體與網絡主權具有內在共生的邏輯功能關系。自媒體和網絡主權是互聯網技術的產物。自媒體是網絡主權的構建物、傳播物、衍生物。從傳播功能主義視角來說,自媒體對網絡主權具有功能性擴張的特質,既具有正向功能擴張,也具有負向功能擴張,需要對負功能性擴張進行規制,防止其破壞網絡主權。自媒體的自由性、開放性、無邊界性、多中心性與網絡主權的秩序性、封閉性、邊界性、單一性相矛盾。發展核心技術、加強法治建設、完善個人隱私法、提升善治水平、實現道德自律等是解決自媒體對網絡主權的負向功能、自媒體與網絡主權的矛盾并保障網絡主權健康發展的主要手段。