《佛說佛醫經》所述代表印度佛教的醫藥觀念。本文自病因論、養生論、業果論三方面探討此經思想。在病因論方面，此經結合印度傳統醫學與佛教學說，指出體素失去均衡、負面心理情緒、飲食作息不當、抑制生理需要、不避危險情況、不善言行舉止等都是有害身心安樂的因素，從較寬闊的視角思考全人健康問題。關於養生論，主要對四季飲食和生活作息予以指點，述說由此達致體素均衡以保持健康。《佛醫經》最後部份，給出戒行的指導，特別偏向飲食、多欲的禍患，及其對治方法的說明。不僅消極地持戒不犯，更應積極通過無相布施、慈悲護命等實踐來對治煩惱，尋求今世與來世的康樂。