西元1680年，一場決定臺灣歷史命運的戰事，從南明鄭經反攻大陸的軍事行動失敗，退回臺灣之後，開始醞釀。1683年歲次癸亥的初夏6月，就在颱風旺季即將開始之際，鄭、清之間的最後決戰，終於在臺海中央的澎湖海域爆發，史稱「澎湖海戰」。這一場決定歷史的會戰，歷時一個星期，鄭軍海上力量幾乎全被殲滅，最後清軍登陸澎湖。稍後，臺灣放棄抵抗，向澎湖清軍無條件投降。8月13日，清軍登陸臺灣。從此，臺灣成為滿清版圖一部分，直到西元1895年5月，甲午戰敗的馬關條約，把臺灣割讓給日本為止。 澎湖海戰具有歷史性的決定意義，它不僅結束南明最終的復國希望，讓入主中國的滿清政權，擁有臺、澎兩個多世紀，使臺灣海峽成為中國的內海。它也讓漢族的海上冒險英雄，在臺海建立異於大陸中國、具有海洋性質政權的希望，趨於幻滅。而這也是中國，繼明初的鄭和七下西洋，燃起海權火種後，又一次的曇花一現。滿清無意於海洋發展，明鄭在臺海所建立的海洋影響力，隨即灰飛煙滅。