2009年4月26日海峽兩岸為保障人民權益，維護兩岸交流秩序，簽署了「海峽兩岸共同打擊犯罪及司法互助協議」，本協議以國際條約、引渡法之基本精神為藍本，雖已具體架構及確立合作模式，但在某些立場上仍與國際刑事司法合作之基本原則有違，本文首先從我國刑事司法合作困境之原因切入，介紹兩岸刑事司法合作之經過，再輔以國際上重要國際刑事司法合作模式之內容，逐一評析本協議曖昧不清及有待補強之處，希望提供意見做為將來進一步修正之參考。