發表於解嚴後六年，《搜神記》（1993）可說是侯俊明獨創之神話系譜學的起源。其中有象徵叛逆少年的哪吒、作為女強人典型的女媧、為理想而不屈不撓進行反抗的刑天，以及各式因慾望過度壓制而變相者。侯俊明曾謂，虛構這部現代社會的搜神錄，其用意乃是冀望「託此結構將都會邊緣人予以神聖化之供奉∕嘲謔」。透過將邊緣者「封聖」，進而構築出的現代神話之檔案圖譜，其中自有嘲謔的作用，從而讓社會道德價值觀，如劃分「主流∕邊緣」與「正常∕異端」之類的迷思，予以問題化，使人得以進行省思。 類似於此，《上帝恨你》（1999）更由神界至鬼界，戲仿基督教的傳道警語與民間信仰的地獄圖，虛構另類之七罪宗和地獄世界，藉以重行審視現代道德規範。如〈上帝憎恨肥胖〉之「塑身地獄」明顯嘲諷現代社會對人外在體態的形塑要求，〈上帝憎恨自己〉之「自責地獄」則意在突顯主體內在自省意識的道德困境。《上帝恨你》除諷刺某些社會現象之荒謬性，亦反思倫理體系的矛盾性。 侯俊明近年創作之《星座十二鍼》（2010），更以星座圖像為本，刻意誇張化占星論述之性格刻板印象，反諷當代占星術的偽科學式話語，及其人格類型說的任意武斷性。由此亦可與阿多諾（T. W. Adorno）在《群星降世》（The Stars Down to Earth）當中，對占星術所顯示的當代非理性文化之批判相參照。 從《搜神記》、《上帝恨你》至《星座十二鍼》，侯俊明創造出一系列自成體系之神、鬼、人的三部曲圖誌，其中分類法的邏輯與內在解構性，尤其值得加以探析。