古云：「大戰之年必有大疫，大災之年必有疾疫」，戰爭常是疾疫形成與流行的間接原因，而疾疫的流行也可能影響戰力，導致交戰一方的失敗。以往有關抗戰史的研究大多著重在政治、外交與軍事面，關於戰爭與疾病的關係並未有深入的論著，因此這個題目仍是有待開發的領域。 本文先描述抗戰後期的疫情，以鼠疫和霍亂作為探討的重心；其次，再探討戰時疫情的防治工作，包括防疫的組織、防疫的方法以及面臨的問題。在結論中探討的主題有三：一是戰爭如何促成疾疫的流行？其次是疾疫對中國戰場上的人民與軍隊所造成何種程度的損失？是否影響戰局的成敗與否？第三是國民政府在這段期間所做的努力與其面臨的問題。 根據抗戰時期留下的檔案資料以及其它史料，讓我們再次更清楚地看到戰爭促成疾疫流行的關係。因為戰爭，為達目的不擇手段的結果，直接造成了傳染病的流行。日軍在抗戰時使用的細菌戰，就是直接導致鼠疫大流行的原因。因為戰爭，部隊必定時常移動駐防，難民也常遷移避難，病菌往往也隨之傳播到別地。疾疫對抗戰時期中國軍民造成的損失，是很難以估計的。雖然比重不算是大，但數目上也相當驚人。國民政府面臨大敵時，不但要顧慮戰爭的勝敗與國家的興亡以外，仍然也對其它民生方面作過努力。防疫組織的建立與防疫工作的提倡，可以反映這一點。雖然戰爭常使防疫工作中斷，百姓的防疫常識不足、環境衛生不佳、醫療器材與人員的缺乏，以及軍紀不佳的影響，使執行的效果大打折扣，但卻不能因此而將政府與國軍的努力一筆抹煞。