譜系是繼續深化研究中古士族的重要問題。中古士族譜系建構的整體特征表現為:六朝的森嚴有序和隋唐的虛實相間。傳世文獻和碑志資料關于士族譜系的記載模式也截然不同:中古時期的正史列傳經常溯及高祖以內具有血緣關系的真實祖先,而碑志則攀附人為構造、亂中有序的虛擬祖先。北朝隋唐郭氏碑志所見的祖先建構,往往包括具有血緣關系的真實祖先和沒有血緣關系的想象祖先。散居各地的郭氏成員,往往追認當地的同姓長官為祖先。唐代郭子儀家族將亦真亦幻的漢代馮翊太守郭孟儒塑造為排他性的祖先,正是這種復雜現象的集中反映。《新唐書·宰相世系表》固然本于《元和姓纂》,但兩書內容前后交錯,互為補充;前者同時還參考了行狀、譜牒和碑志等資料。中古時期的譜牒、家狀和碑志等資料共同成為兩大姓氏書的主要史源。中古士族祖先建構的虛實變化,見證了士族階層和政治社會極為復雜的演變過程。