光緒十八年(1892)康有為「選同學高才助纂焉」，開始編纂《孔子改制考》。經過六年，到了光緒二十三年(1897)冬，弟康廣仁於上海大同譯書局刊刻之。於翌年五月初一，進呈光緒皇帝。成為康氏變法思想主要的理論依據。在本書中，康氏將孔子塑造成一位「改革者」。蓋對中國人，尤其是傳統讀書人而言，最大的權威，莫過於孔子。所以如果能重塑孔子的形象，使其為清末中國維新運動代言，那麼對於變法改革的推行，必然能增加說服力，並且減少阻力。《孔子改制考》就在這樣的動機底下完成的。
光緒二十四年(1898)，戊戌政變之後，康有為逃亡海外，結束了政治生涯的高峰期，同時《孔子改制考》亦遭到禁刊、焚毀的命運。然而，誠如蕭公權先生所云：「康有為的改革與烏托邦思想，畢竟對中國思想史有重要貢獻。因為此一貢獻，他將長受學界的重視。」(《康有為思想研究》，頁35-36)《孔子改制考》計有二十一卷，其內容所牽涉的範圍，幾乎涵蓋了中國思想的主要範疇，以及思想的基本現象。例如：
(1)卷一、二、三、七、八、九等，涉及到思想興起的背景，以及諸子思想的建立。其中，以「上古茫昧無稽」，作為思想、文化的起源，乃至作為解釋思想家立論時的「託古」背景，相當具有創意。
(2)卷四、十、十二等，考證諸子「託古」的運用。此一現象雖然早在東漢王充就曾提及，但以專篇加以討論的，則始於《孔子改制考》。
(3)卷五、十三、十四、十五、十六、十七等，提到諸子「互攻」，也就是思想批評的現象。
(4)卷六、十、十九、二一等，除了提到思想流派的現象外，最重要的就是涉及思想之所以興盛的原因。
就以上《孔子改制考》所涉及的主題而言，不論在思想深度或廣度上，都相當具有研究的價值。故本文研究的動機，乃希望在康氏的基礎上，對《孔子改制考》作一分析、歸納，找出思想發展的相關理論，進而對中國思想的特質與現象，有一更為深入的了解與詮釋。
本論文主要分為十一章。第一章〈緒論〉。第一節，說明本文的研究動機；第二節，略述《孔子改制考》的主旨。這樣安排的目的，乃基於假設讀者從未接觸過本書，故如果能在本文緒論中，對《孔子改制考》主旨先做一略述。如此一來，在翻閱往後的章節時，就有一基本的概念，也比較容易掌握；第三節，敘述《孔子改制考》的編輯與付梓的過程；第四節，介紹本書的形式結構，並透過對徵引文獻的統計，希望歸納出有用的相關資訊；第五節，說明本論文章節安排的目的。說明本文的篇章結構、目次安排的原因。
第二章〈康有為生平及其變歷程〉。主要對康有為的生平，以及提倡維新運動的歷程，作一概略的介紹。本文並未將「時代背景」，單獨列為一章。蓋當代大事或歷史事件，每個人的解讀不同，甚至有的思想家根本不以為意，故如果僅泛論清末，乃至於清中葉以來的歷史，作為「時代背景」一章，那麼將使本論文節奏顯得鬆散。故本章以《康南海自編年譜》為主，並將與康氏有關的時代事件，穿插於本章之中。
第三章〈論思想啟發--《孔子改制考》與廖平《知聖篇》的關係〉。探討康氏《孔子改制考》的思想淵源，也就思想啟發的問題。既然是思想「淵源」，那麼它的位置就應在思想「形成」之前，在探討《孔子改制考》所有相關的問題之前。一般學者認為《孔子改制考》主要受到廖平《知聖篇》的影響。本章由思想形成的歷程，來探討這個問題。
由第四章起，至第九章止，計有六章，乃本論文的主要重點。分別為第四章〈先秦諸子思想的崛起〉、第五章〈先秦諸子的互攻與傳承〉、第六章〈孔子的創教〉、第七章〈孔子改制託古〉、第八章〈孔教與諸子的互攻〉、第九章〈孔教的興盛〉。在這六章當中，分別將《孔子改制考》二十一卷作一分類。分別探討康氏所謂先秦諸子思想的崛起、託古、批評、傳承、以及興盛。第四〈先秦諸子思想的崛起〉、第五章〈先秦諸子的互攻與傳承〉，對象為先秦諸子，不包含孔子；由第六章起至第九章止，計有四章則專論孔子。這是康氏著作本書的主要目的與重點，但它所牽涉的思想現象，與前五卷中的諸子無異，依然有「崛起」、「託古」、「互攻」、「後學」、以及「興盛」等現象。理論上，既然是專談孔子，應合為一章，但本論文給予四章的篇幅，主要原因在於，一來這一部分，乃康氏的重點，若只安排一章，似乎無法呼應、彰顯康氏著書的目的；二來，《孔子改制考》中，談論孔子部分，由卷七至卷二十一，共十五卷，佔本書所有卷數的七成以上，若本論文只以一章的篇幅探討，又顯得與原著，在份量不能相應。
第十章〈康有為與孔教運動〉。探討康氏對孔教的塑造。當然這可由主、客觀等方面加以探討。主觀方面，探討康有為救世的理想，亦即是宗教情操；客觀方面，探討孔教的組成要素，如「教主」、「教義」、「聖經」、「門徒」等。最後一節，則敘述提倡孔教為國教的歷程。
第十一章〈結論〉。本章總結《孔子改制考》二十一卷當中，康氏考據論證的缺失，以及與思想相關的議題，加以整理、略述。目前本人的能力僅止於此！但希望這些思想議題，能夠成為博士後研究的基礎與方向。