以下參考書目，典籍與學位論文依時代或時間先後排序，除此之外，則依作者姓名筆劃順序排列。
(一) 典籍 (依時代先後排列)
(漢)司馬遷：《史記》，北京：中華書局，2003年。
(宋)周敦頤：《周敦頤》，北京：中華書局，2009年。
(宋)張 載：《張載集》，北京：中華書局，2006年。
(宋)程顥、程頤：《二程集》，北京：中華書局 2004年。
(宋)張伯端：《悟真篇》，收錄於《修真十書》，《道藏》(三家本)第四冊，北京：文物出版社，1988年。
(宋)朱 熹：《朱子全書》，上海：上海古籍出版社；合肥：安徽教育出版社，2002年。
(宋)朱 熹：《朱子全書外編》，上海：華東師範大學出版社，2010年。
(宋)朱 熹：《朱子語類》，北京：中華書局，2004年重印。
(宋)張 栻：《張栻全書》，長春：長春出版社，1999年。
(宋)呂祖謙：《東萊別集》，《文淵閣四庫全書》，臺北：臺灣商務印書館，1983年。
(宋)陸九淵：《陸九淵集》，北京：中華書局，2008年。
(明)曹 端：《曹端集》，北京：中華書局，2003年。
(明)胡居仁：《居業錄》，臺北：廣文書局，1991年。
(明)薛 瑄：《薛瑄全集》，太原市：山西人民出版社，1990年。
(明)陳獻章：《陳獻章集》，北京：中華書局，2008年。
(明)莊 昶：《定山集》，《景印文淵閣四庫全書》集部第193冊(總第1254冊)，臺北市：臺灣商務印書館，1983年。
(明)林 光：《南川冰蘖全集》，北京：中國文史出版社，2004年。
(明)羅欽順：《困知記》，北京：中華書局，1990年。
(明)湛若水：《泉翁大全集》八十五卷，嘉靖十九年刻，萬曆二十一年修補本，今藏臺灣國家圖書館。
《甘泉先生續編大全》三十三卷，嘉靖三十四年刻，萬曆二十三年修補本，今藏臺灣國家圖書館。
以上兩善本之標點整理(鍾彩鈞校點)，可見中央研究院漢籍電子文獻，http://www.sinica.edu.tw/~tdbproj/handy1/
《甘泉先生文錄》二十一卷，嘉靖九年刻本，《故宮珍本叢刊》第527冊，海口：海南出版社，2000年。 (原刻本書名作：甘泉先生文錄類選)
《甘泉先生文集》四十卷，嘉靖十五年刻本，今藏北京大學圖書館。
《甘泉先生文集》四十卷，《儒藏》精華編‧二五三 (董平校點)，北京：北京大學出版社，2009年。
《甘泉先生文集》三十五卷，萬曆七年刻本，今藏中國國家圖書館。
《湛甘泉先生文集》，清康熙二十三年黃楷刻本，《四庫全書存目叢書》集部‧別集第56、57冊，臺南：莊嚴文化事業出版，1997年。
《重遊南岳紀行錄》一卷，嘉靖三十五年刻本，今藏中國國家圖書館。
《楊子折衷》，明嘉靖葛澗刻本，《續修四庫全書》子部儒家類，第938冊，上海：上海古籍出版社，1995年。
《格物通》，《文淵閣四庫全書》，第716冊，臺北：臺灣商務印書館，1983年。
《遵道錄》，《中國子學名著集成》，第43冊，臺北：中國子學名著集成基金會，1978年。
《白沙先生詩教解、外傳》，明刻本，《四庫存目叢書》，集部‧別集第35冊，臺南：莊嚴文化事業出版，1997年。
《二禮經傳測》，明刻本，《四庫存目叢書》，經部禮類第104冊，臺南：莊嚴文化事業出版，1997年。
《古樂經傳全書》，明嘉三十四年祝廷滂刻本，《四庫存目叢書》，經部樂類第182冊，臺南：莊嚴文化事業出版，1997年。
《春秋正傳》，《文淵閣四庫全書》，第64-66冊，臺北：臺灣商務印書館，1973年。
(明)夏尚樸：《夏東巖先生文集》，《北京圖書館古籍珍本叢刊》，北京：書目文獻出版社，1988年。
(明)王守仁：《王陽明全集》，上海：上海古籍出版社，2006年。
(明)王守仁，陳榮捷編著：《王陽明傳習錄詳註集評》，臺北：臺灣學生，1998年。
(明)方獻夫：《西樵遺稿》，清康熙三十五年方林鶴刻本，《四庫存目叢書》集部別集第59冊，臺南：莊嚴文化，1995年。
(明)黃 綰：《明道編》，北京：中華書局，1959年。
(明)嚴 嵩：《鈐山堂集》，《續修四庫全書》第1336冊，上海：上海古籍出版社，2002年。
(明)王 艮：《王心齋全集》，臺北：廣文書局，1987年。
(明)魏 校：《莊渠遺書》，王雲五主編《四庫全書珍本‧五集》，臺北：臺灣商務印書館，1974年。
(明)聶 豹：《聶豹集》，《陽明後學文獻叢書》，南京：鳳凰出版社，2007年。
(明)王 道：《王文定公遺書》二十卷，明萬曆三十七年朱延禧南京刊本，今藏臺灣國家圖書館。
(明)鄒守益：《鄒守益集》，《陽明後學文獻叢書》，南京：鳳凰出版社，2007
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(明)唐 樞：《一菴雜問錄》，明萬曆繡水水沈氏刻寶顏堂祕笈本，《四庫存目叢書》，子部雜家類第84冊，臺南：莊嚴文化事業出版，1995年。
(明)洪 垣：《覺山先生緒言》，《續修四庫全書》子部雜家類第1124冊，上海：上海古籍出版社，1995年。
(明)王 畿：《王畿集》，《陽明後學文獻叢書》，南京：鳳凰出版社，2007年。
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(明)羅洪先：《羅洪先集》，《陽明後學文獻叢書》，南京：鳳凰出版社，2007年。
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(明)馮從吾：《少墟集》，《文淵閣四庫全書》第1293冊，臺北：臺灣商務印書館，1983年。
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(明)黃宗羲：《明儒學案》(沈芝盈點校)，北京：中華書局，1985年。
(清)全祖望：《鲒埼亭集》，臺北：國立編譯館，2003年。
(清)陸世儀：《思辨錄輯要》，《文淵閣四庫全書》第724冊，臺北：臺灣商務印書館，1983年。
(清)黃虞稷，瞿鳳起、潘景鄭整理：《千頃堂書目》，上海：上海古籍出版社，2001年。
(二) 近人論著
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于化民：《明中晚期理學的對峙與合流》，臺北：文津出版社，1993年。
方東美：《新儒家哲學十八講》，臺北：黎明文化，1993年。
王俊彥：《王廷相與明代氣學》，臺北：秀威資訊科技，2005年。
王邦雄等編著：《中國哲學史》，臺北：國立空中大學，1995年。古清美：《明代理學論文集》，臺北：大安出版社，1990年。
古清美：《慧菴論學集》，臺北：大安出版社，2004年。
牟宗三：《心體與性體》，臺北：正中書局，1990年。牟宗三：《中國哲學十九講》，臺北：臺灣學生書局，1999年。
牟宗三：《從陸象山到劉蕺山》，臺北：臺灣學生書局，2000年。
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呂思勉：《理學綱要》，臺北：華世出版社，1977年。
呂妙芬：《陽明學士人社群：歷史、思想與實踐》，北京：新星出版社，2006年。
岡田武彥：《王陽明與明末儒學》(吳光、錢明、屠承先譯)，上海：上海古籍出版社，2000年。
李存山：《中國氣論探源與發微》，北京：中國社會科學出版社，1990年。
余英時：《歷史與思想》，臺北市：聯經出版社，1976年。
余英時：《士與中國文化》，上海：上海人民出版社，2003年。
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林繼平：《明學探微》，臺北：臺灣商務印書館，1984年。
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吳 震：《陽明後學研究》，上海：上海人民出版社，2003年。
吳 震：《泰州學派研究》，北京：中國人民大學出版社，2009年。
侯外廬、邱漢生、張豈之編：《宋明理學史》，北京：人民出版社，1997年。
祝平次：《朱子學與明初理學的發展》，臺北：臺灣學生書局，1994年。容肇祖：《明代思想史》，臺北：臺灣開明書店，1962年3月。
容肇祖：《中國歷代思想史：明代卷》，臺北：文津出版社，1993年。
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唐君毅：《中國哲學原論‧導論篇》，臺北：臺灣學生書局，1993年。
唐君毅：《中國哲學原論‧原教篇》，臺北：臺灣學生書局，2004年。
袁保新：《孟子三辨之學的歷史省察與現代詮釋》，臺北：文津出版社，1992年。孫振青：《宋明道學》，臺北：國立編譯館，1986年。徐復觀：《中國思想史論集》，臺北：臺灣學生書局，1975年。
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陳 來：《有無之境─王陽明哲學的精神》，北京：人民出版社，1997年。
陳 來：《朱子哲學研究》，上海：華東師範大學出版社，2000年。
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陳郁夫：《江門學記—陳白沙及湛甘泉研究》，臺北：學生書局，1984年。
陳鼓應、辛冠潔、葛榮晉編：《明清實學思潮史》，濟南：齊魯書社，1989年。
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陳鐘凡：《兩宋思想述評》，臺北：華世出版社，1977年。
張立文：《宋明理學邏輯結構的演化》，臺北：萬卷樓圖書公司，1993年。
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蒙培元：《理學的演變─從朱熹到王夫之戴震》，福建：福建人民出版社，1998年。
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2. 單篇論文
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朱鴻林：〈明代嘉靖年間的增城沙堤鄉約〉，《中國近世儒學實質的思辨與習學》(北京：北京大學出版社，2005年)，頁256-311。
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鍾彩鈞：〈儒家與民間信仰的關係：以湛甘泉《參贊事略》為例〉，《傳承與創新：中央研究院中國文哲研究所十周年紀念論文集》(臺北：中央研究院中國文哲研究所籌備處，1999年)，頁491-520。(三) 學位論文 (依時間先後排列)
黃敏浩：《湛甘泉的生平及其思想》，臺灣大學中國文學研究所碩士論文，張亨指導，1988年。
潘振泰：《湛若水與明代心學》，臺灣師範大學歷史研究所碩士論文，王家儉指導，1992年。賴昇宏：《湛甘泉理學思想之研究》，中國文化大學中國文學研究所碩士論文，王俊彥指導，1998年。張佑珍：《從出世到入世─湛若水對「學宗自然」之闡釋》，成功大學中國文學研究所碩士論文，祝平次指導，2003年。
李宇婷：《湛甘泉哲學思想之研究》，中國文化大學哲學研究所碩士論文，姜允明指導，2003年。
劉同輝：《湛若水教育心理思想之研究》，上海師範大学教育研究所碩士論文，燕國材指導，2003年。
張伯宇：《湛甘泉心學思想研究》，淡江大學中國文學研究所碩士論文，周志文、殷善培指導，2004年。
虞瀟浩：《湛甘泉學說中的理氣與心》，復旦大學碩士論文，2004年。
吳愛邦：《隨處體認天理─湛若水道德修養理論研究》，華南師範大學政治與行政學院碩士論文，江雪蓮、鄭維銘指導，2005年。
童中平：《隨處體認天理─湛甘泉哲學研究》，華東師範大學哲學系博士論文，高瑞泉指導，2007 年。
張曉劍：《湛若水的“體用渾一”之學與踐履》，浙江大學古典文獻學研究所博士論文，束景南指導，2008年。
黎業明：《湛若水生平與學術思想研究》，中山大學哲學系博士論文，馮達文指導，2009年。
王文娟：《湛甘泉哲學思想研究》，北京大學哲學系博士論文，陳來指導，2011年。
(四)、外文資料
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志賀一朗：〈王陽明と湛甘泉〉，《日本中国学会报》第21集，1969年。
志賀一朗：《湛甘泉の研究 》， 東京：風間書房，1980年。
志賀一朗：《湛甘泉の学説》，東京：風間書房，1983年。
志賀一朗：《湛甘泉と王陽明の関係》，東京：風間書房，1985年。
志賀一朗：《湛甘泉の教育》，東京：風間書房，1987年。
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Woo, Ann-ping Chin,Chan Kan-ch’uan and the continuing Neo-Confucian discourse on mind and principle,Ann Arbor, Mich. : University Microfilms International, 1987, c1985.