以「超驗」取代中世紀的「超越」，乃是康德哲學的著意之筆，由此阻塞了由知識直接通向形而上學與信仰的道路；牟宗三哲學的出發點，原是要通過扭轉康德而恢復「超越」的古義，在肯定人有「智知」(智的直覺、自由無限心) 的前提下，重新賦予「超越」概念以某種存有、實有、實在的內涵，重建超越的存有論。但是，認同於康德主體主義的路向與徹底取消神、人之間的界限相統一，又使得牟宗三對於「超越」概念的理解與限定及其由此所展開的思想系統，似乎搖擺於前康德時代的超越存有論與後康德時代的人本主義哲學之間。