乾隆末年，清廷於臺灣推行的屯番制度，創造出兩種新的熟嶓地權—屯餉與養贍埔地，以之為屯番的薪俸。此後，清廷為了維持屯番制度的運行，對這兩種熟番地權給予一定程度的關注與維護。因此屯番制度也成為臺灣後半期最主要，也是最有系統的番地保護措施。 以往關於屯制之制度層面的研究，多認為此制度的問題叢生。然而在屯番制度與熟番地權的關係方面，柯明的研究卻指出屯制對於番地的保護有一定的成效。誠然，清侹維護屯番地槽的態度頗為積，不斷的清釐屯業、整頓屯務，希望保持原本規劃的數額，保障屯番的收益。但以整個制度的演進過程觀之，屯制之發展因為面臨眾多的內外因素，而顯的漏窳百出，屯餉與養贍埔地也因此不斷地流失。依規定，屯餉是由官方向屯地徵收屯租，而從中撥發屯餉給屯番。然而在收發的過程中，卻往往發生地方官員執行不力、屯弁私吞屯餉、官府挪用屯租等問題，致使屯餉的發放常不足數。又養贍埔地因距離屯所過程，屯番必須將土地租佃與漢人耕種，漢佃越界霸佔、抗納短欠之弊層出不窮；而且民間土地交易的管道與名目相當眾多，官員頒行的措施實難禁絕屯業之違法交易。最終，在屯番收入已毫無保障的情況下，屯番制度遂於清末廢弛。易言之，清廷對於屯番田業保護態度雖然積極，但是保護成果卻不完善，而其原因系來自官府、民間，以及制度本身等各方面。